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【存储工程】存储编码技术:从变长整数到字典编码

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上一篇我们讨论了数据湖表格式如何在 Parquet 文件之上管理元数据。但无论是 Delta Lake、Iceberg 还是 Hudi,它们底层的列式文件格式能做到多高的压缩率、多快的解码速度,很大程度上取决于一个更底层的问题:数据在写入磁盘之前,用什么方式编码?

编码(Encoding)处于存储栈的关键位置——它在原始数据和压缩算法之间。好的编码能让数据的冗余模式变得更显式,后续的通用压缩算法(Snappy、Zstd、LZ4)才能更高效地工作。坏的编码则可能让压缩算法无从下手,甚至引入不必要的解码开销。

本文从变长整数编码(VarInt)讲起,逐一拆解差值编码(Delta Encoding)、字典编码(Dictionary Encoding)、游程编码(Run-Length Encoding)、位图编码(Bitmap Encoding)和位打包(Bit Packing)六种核心编码技术,分析每种编码的原理、适用条件和工程实现,再讨论混合编码策略和性能对比。所有讨论基于 Apache Parquet Format 规范 2.10、Apache ORC 规范 1.9、Protocol Buffers 编码规范和 Roaring Bitmap 论文。


一、为什么编码方式决定存储效率

1.1 编码在存储栈中的位置

一条数据从应用程序到磁盘,经历的路径大致如下:

应用层数据
    │
    ▼
序列化(Serialization)    将内存对象转为字节序列
    │
    ▼
编码(Encoding)           利用数据特征减少字节数
    │
    ▼
压缩(Compression)        通用算法消除字节级冗余
    │
    ▼
写入磁盘 / 网络传输

序列化关注的是如何把内存中的结构化对象(结构体、对象、消息)转为字节序列。编码关注的是如何利用数据本身的统计特征(值域集中、重复率高、递增趋势)减少所需字节数。压缩则是在编码后的字节流上,用 LZ 系列、Huffman、ANS 等通用算法进一步消除冗余。

三者的边界并不总是清晰。Protocol Buffers 的变长整数编码(VarInt)既是序列化格式的一部分,也是一种编码技术。Parquet 的字典编码既减少了存储空间,也可以看作一种轻量压缩。但从工程角度看,区分三者有助于理解每一层的优化空间:

这意味着编码层做得越好,留给压缩层的工作就越少,解压开销也越小。在列式存储(Columnar Storage)中这一点尤其明显:同一列的数据类型一致、值域相近,编码层有大量可利用的信息。

1.2 定长编码的浪费

最直观的编码方式是定长编码(Fixed-Length Encoding):每个值占用固定字节数。例如一个 64 位整数始终占 8 个字节,不管它的值是 0 还是 9223372036854775807。

考虑一个典型的用户事件表,包含一个 event_type 列,值域只有 ["click", "view", "purchase", "scroll"] 四种。如果用定长的 64 位整数存储,每个值占 8 字节。但实际上只有 4 个不同的值,2 个比特(Bit)就足够区分。100 万行数据中:

空间差距超过 30 倍。这不是极端案例——列式存储中低基数(Low Cardinality)列非常普遍,性别、国家代码、状态枚举、日志级别都属于这一类。

1.3 编码选择的权衡

编码不只是追求最小空间。一个好的编码方案需要在三个维度之间取舍:

  1. 空间效率:编码后数据占用多少字节。
  2. 编码速度:写入时把原始值转为编码格式需要多少 CPU 时间。
  3. 解码速度:读取时从编码格式还原原始值需要多少 CPU 时间。

在分析型工作负载(OLAP Workload)中,数据通常写一次读多次,因此解码速度往往比编码速度更重要。这就是为什么位打包(Bit Packing)在列式存储中被广泛采用——它的解码可以通过位移和掩码操作批量完成,对现代 CPU 的 SIMD 指令非常友好。

而在日志系统和消息队列中,写入吞吐量是瓶颈,编码速度不能太慢。Kafka 选择不做复杂编码,直接把消息以原始字节写入,把压缩留给批量压缩层。

我认为编码选择的核心原则是:编码方案必须匹配数据的统计特征和访问模式。对递增时间戳用差值编码,对低基数字符串用字典编码,对高基数浮点数直接用定长编码——没有万能的编码方式,只有合适的编码方式。


二、变长整数编码

2.1 定长整数的问题

整数是存储系统中最常见的数据类型。主键、外键、时间戳、计数器、偏移量——大量字段本质上都是整数。在大多数编程语言和文件格式中,整数用定长表示:int32 占 4 字节,int64 占 8 字节。

但实际数据中,整数值的分布往往高度偏斜。以一个用户 ID 列为例,假设当前用户量 500 万,ID 从 1 到 5000000。最大值 5000000 只需要 23 个比特(2^23 = 8388608),但用 int64 存储时每个值都要占 8 字节(64 比特),其中 41 个比特始终为零。这些零比特就是纯粹的浪费。

变长整数编码(Variable-Length Integer Encoding,简称 VarInt)的核心思想是:用更少的字节表示小值,用更多的字节表示大值。由于实际数据中小值出现的频率远高于大值,平均每个值的字节数会显著低于定长编码。

2.2 VarInt 编码原理

VarInt 最广泛的实现来自 Protocol Buffers(以下简称 Protobuf)。编码规则如下:

  1. 将整数的二进制表示从低位到高位,每 7 个比特分为一组。
  2. 每组前面加一个比特作为继续标志(Continuation Bit):1 表示后面还有字节,0 表示这是最后一个字节。
  3. 各组按小端序(Little-Endian)排列。

以整数 300 为例:

300 的二进制表示:100101100(9 比特)

分组(每 7 比特一组,低位在前):
  第一组:0101100(低 7 位)
  第二组:0000010(高 2 位,补零至 7 位)

添加继续标志位:
  第一字节:1 0101100 = 0xAC(继续标志 = 1,后面还有字节)
  第二字节:0 0000010 = 0x02(继续标志 = 0,这是最后一个字节)

编码结果:[0xAC, 0x02](2 字节,比定长 int32 的 4 字节少 50%)

不同值对应的 VarInt 字节数:

值范围 VarInt 字节数 定长 int32 字节数 节省比例
0 ~ 127 1 4 75%
128 ~ 16383 2 4 50%
16384 ~ 2097151 3 4 25%
2097152 ~ 268435455 4 4 0%
268435456 ~ 2^35-1 5 4 -25%

可以看到,当值超过 2^28 时,VarInt 反而比定长 int32 多用字节。对于 int64,VarInt 最多需要 10 个字节(64 比特 / 7 比特每组 = 10 组,向上取整),而定长只需 8 字节。因此 VarInt 只在值普遍较小时有优势。

2.3 ZigZag 编码

VarInt 对无符号整数效果很好,但对有符号整数有一个严重问题:负数。

在补码表示(Two’s Complement)中,-1 的 64 位二进制是全 1(0xFFFFFFFFFFFFFFFF)。如果直接用 VarInt 编码,-1 需要 10 个字节——比定长 int64 的 8 字节还多。所有负数都有同样的问题,因为补码表示中负数的高位全是 1。

ZigZag 编码解决这个问题的方式很巧妙:把有符号整数映射为无符号整数,使得绝对值小的数映射为小的无符号数。映射规则如下:

原始值    ZigZag 编码值
  0    →    0
 -1    →    1
  1    →    2
 -2    →    3
  2    →    4
 -3    →    5
  3    →    6
 ...       ...

编码公式(以 32 位整数为例):

// 编码:有符号 → 无符号
uint32_t zigzag_encode(int32_t n) {
    return (n << 1) ^ (n >> 31);
}

// 解码:无符号 → 有符号
int32_t zigzag_decode(uint32_t n) {
    return (n >> 1) ^ -(n & 1);
}

n >> 31 是算术右移(Arithmetic Right Shift),负数得到全 1(即 0xFFFFFFFF),正数得到全 0。异或操作的效果是:正数保持不变但左移一位,负数按位取反后左移一位。这样 -1 变成 1,-2 变成 3,绝对值小的数始终映射为小的无符号数。

ZigZag + VarInt 的组合编码使得 -1 只需要 1 个字节(ZigZag 编码为 1,VarInt 编码为 0x01),而不是 10 个字节。

2.4 Protobuf 中的选择

Protobuf 提供了三种整数编码选项:

类型 编码方式 适用场景
int32 / int64 直接 VarInt 值总是非负或极少为负
uint32 / uint64 直接 VarInt 值总是非负
sint32 / sint64 ZigZag + VarInt 值可能为负且绝对值较小
fixed32 / fixed64 定长 4/8 字节 值普遍较大(超过 2^28 / 2^56)

为什么 Protobuf 不默认用 ZigZag?因为 ZigZag 对正数会多用一个比特:正数 n 被映射为 2n,所以 64 变成 128,刚好多一个字节。如果业务上确定值总是非负的(如 ID、长度、计数),直接 VarInt 比 ZigZag + VarInt 更紧凑。

这个设计决策的工程启示是:编码选择必须基于对数据分布的了解。盲目选择”最通用”的编码往往不是最优的。Protobuf 把这个选择权交给开发者,通过 .proto 文件中的类型声明来指定。

2.5 VarInt 解码的性能问题

VarInt 编码紧凑,但解码有一个固有缺陷:每个值的长度不固定,必须逐字节解析继续标志位才能确定当前值的边界。这意味着:

  1. 无法随机访问(Random Access)——要读取第 N 个值,必须先解码前 N-1 个值。
  2. 无法利用 SIMD 指令并行解码——因为各值的字节边界未知。
  3. 分支预测不友好——每个字节都要判断继续标志位。

对于需要高速扫描大量整数的场景(如列式存储的全列扫描),VarInt 的解码性能是一个瓶颈。这也是为什么 Parquet 和 ORC 在列式编码中更偏好位打包(Bit Packing)而不是 VarInt——位打包虽然需要预先知道每个值的位宽(Bit Width),但解码可以用位移和掩码批量完成。

实际工程中的常见优化是Group VarInt 编码(VARINT-GB),由 Jeff Dean 在 2009 年提出。基本思路是把 4 个 VarInt 值分为一组,用一个控制字节(Control Byte)记录每个值的字节长度,然后连续存放 4 个值的字节。这样解码时只需读一个控制字节就能确定 4 个值的边界,减少了分支预测失败的次数,也为 SIMD 优化留下了空间。


三、差值编码与前缀编码

3.1 差值编码原理

差值编码(Delta Encoding)的核心思想是:存储相邻值的差值(Delta),而不是原始值。当数据具有递增或缓慢变化的趋势时,差值通常远小于原始值,用更少的比特就能表示。

以一组递增的时间戳为例:

原始值(Unix 时间戳,毫秒):
  [1695100000000, 1695100000050, 1695100000120, 1695100000180, 1695100000210]

差值编码后:
  基准值:1695100000000
  差值:[50, 70, 60, 30]

原始值每个需要 41 比特(2^41 > 1.695 × 10^12)
差值每个只需要 7 比特(最大差值 70 < 128)

空间节省是显著的:原始值需要至少 5 x 41 = 205 比特,差值编码只需要 41 + 4 x 7 = 69 比特,压缩率约 3:1。

差值编码在以下数据上效果最好:

3.2 Parquet 的 Delta Binary Packed 编码

Parquet 从 2.0 版本开始支持 Delta Binary Packed 编码(DELTA_BINARY_PACKED),这是差值编码和位打包的组合。编码过程分三步:

  1. 计算差值:以第一个值为基准,计算后续每个值与前一个值的差值。
  2. 分块:将差值序列分为多个块(Block),每个块包含若干个小块(Mini Block)。
  3. 位打包:在每个小块内,找到差值的最大位宽,用该位宽对所有差值进行位打包。
Delta Binary Packed 编码结构

┌──────────────────────────────────────────────────┐
│ Header                                           │
│ ├── Block Size(每块的值个数)                     │
│ ├── Mini Block Count(每块的小块数)               │
│ ├── Total Value Count(总值个数)                  │
│ └── First Value(第一个原始值,ZigZag + VarInt)   │
├──────────────────────────────────────────────────┤
│ Block 0                                          │
│ ├── Min Delta(本块差值的最小值,ZigZag + VarInt) │
│ ├── Bit Widths(各小块的位宽,每个 1 字节)        │
│ ├── Mini Block 0(位打包的差值)                   │
│ ├── Mini Block 1(位打包的差值)                   │
│ └── ...                                          │
├──────────────────────────────────────────────────┤
│ Block 1                                          │
│ └── ...                                          │
└──────────────────────────────────────────────────┘

每个块内还有一个优化:存储的不是原始差值,而是差值减去本块最小差值(Min Delta)后的结果。这样所有值都变为非负数,位宽进一步缩小。

以具体数字为例:

原始值:[100, 102, 104, 106, 108, 110, 112, 114]

差值:[2, 2, 2, 2, 2, 2, 2]
Min Delta = 2
调整后差值:[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]

位宽 = 0(所有值都是 0)

当差值完全恒定时(如自增 ID 间隔固定),位宽为 0,只需要存储基准值和 Min Delta,空间接近为零。这就是 Parquet 对等差序列的极端优化。

3.3 时间序列数据的双重差值编码

在时间序列数据库(Time-Series Database,简称 TSDB)中,时间戳不仅递增,而且增量本身也相对稳定。例如每秒采集一次的监控指标,时间戳差值大多是 1000 毫秒,偶尔因为网络延迟偏移几毫秒。

对这种数据,可以做二阶差值编码(Delta-of-Delta Encoding,也称双重差值编码):

原始时间戳(毫秒):
  [1695100000, 1695101000, 1695102000, 1695103000, 1695104005]

一阶差值:
  [1000, 1000, 1000, 1005]

二阶差值(差值的差值):
  [0, 0, 5]

Gorilla 论文(Facebook 2015 年发表)将这种方法应用到其内存时间序列数据库中。Gorilla 的时间戳编码方案是:

  1. 第一个时间戳存储完整值。
  2. 第二个时间戳存储与第一个的差值(Delta)。
  3. 后续时间戳存储二阶差值(Delta-of-Delta),并用变长编码:
    • 如果二阶差值为 0,只写 1 个比特(0)。
    • 如果在 [-63, 64] 范围内,写 10 + 7 比特。
    • 如果在 [-255, 256] 范围内,写 110 + 9 比特。
    • 如果在 [-2047, 2048] 范围内,写 1110 + 12 比特。
    • 否则写 1111 + 32 比特。

在理想情况下(采集间隔完全一致),每个时间戳只需要 1 个比特。实测在 Facebook 的生产数据上,时间戳的平均压缩率达到每个值 1.37 比特。

InfluxDB 的 TSM(Time-Structured Merge)存储引擎也采用了类似的方案。Prometheus 的 TSDB 从 2.0 版本开始同样使用 Gorilla 风格的编码。这说明双重差值编码已经成为时间序列存储的事实标准(De Facto Standard)。

3.4 前缀编码

前缀编码(Prefix Encoding,也称前端压缩,Front Compression)是差值编码在字符串上的类比。思路是:对排序后的字符串序列,每个字符串只存储与前一个字符串不同的后缀部分,以及共同前缀的长度。

排序后的字符串:
  ["storage_engine_btree",
   "storage_engine_lsm",
   "storage_format_orc",
   "storage_format_parquet"]

前缀编码后:
  [0, "storage_engine_btree"]     完整字符串
  [15, "lsm"]                    与前一个共享 15 个字符
  [8, "format_orc"]              与前一个共享 8 个字符
  [15, "parquet"]                与前一个共享 15 个字符

前缀编码在 B+ 树(B+ Tree)索引中应用广泛。SQLite 的 B 树页内就使用前缀压缩来减少键的存储空间。LevelDB / RocksDB 的 SSTable 文件中,每个数据块(Data Block)内部也对键做前缀编码,每隔固定间隔(默认 16 个键)存储一个完整键作为重启点(Restart Point),以支持块内的二分查找。


四、字典编码

4.1 字典编码原理

字典编码(Dictionary Encoding)的思路非常直接:建立一个值到整数索引的映射表(字典),然后用整数索引代替原始值。当列的不同值数量(基数,Cardinality)远小于行数时,字典编码能大幅减少存储空间。

原始数据(字符串列,100 万行):
  ["Beijing", "Shanghai", "Guangzhou", "Beijing", "Shenzhen", "Beijing", ...]

字典:
  0 → "Beijing"
  1 → "Shanghai"
  2 → "Guangzhou"
  3 → "Shenzhen"

编码后的索引序列:
  [0, 1, 2, 0, 3, 0, ...]

原始数据:平均每个值 8 字节 x 100 万 = 7.63 MB
字典编码后:字典约 30 字节 + 索引 100 万 x 2 比特 = 约 0.24 MB

字典编码的收益取决于两个因素:

  1. 基数(Cardinality):不同值的数量越少,索引的位宽越小。基数为 N 的列,索引位宽为 ceil(log2(N))。
  2. 原始值的平均大小:原始值越大(如长字符串),用短整数索引替代的收益越高。

4.2 Parquet 中的字典编码

Parquet 默认对所有类型的列尝试字典编码(PLAIN_DICTIONARY / RLE_DICTIONARY)。编码流程如下:

  1. 写入阶段:Parquet 写入器(Writer)在写入每个数据页(Data Page)时,维护一个字典。每遇到一个新值,就加入字典并分配一个整数索引。
  2. 字典页(Dictionary Page):每个列块(Column Chunk)的开头写入一个字典页,存储所有不同值。
  3. 数据页(Data Page):存储的不是原始值,而是整数索引序列,索引使用 RLE / Bit Packing 混合编码。
  4. 回退机制(Fallback):如果字典的大小超过阈值(默认为数据页大小,通常 1 MB),Parquet 会放弃字典编码,改用 PLAIN 编码。这防止了高基数列(如用户 ID、UUID)的字典无限膨胀。
Parquet 列块中的字典编码结构

┌───────────────────────────────────┐
│ Column Chunk                      │
├───────────────────────────────────┤
│ Dictionary Page                   │
│ ├── Num Entries: 4                │
│ ├── Entry 0: "Beijing"           │
│ ├── Entry 1: "Shanghai"          │
│ ├── Entry 2: "Guangzhou"         │
│ └── Entry 3: "Shenzhen"          │
├───────────────────────────────────┤
│ Data Page 0                       │
│ ├── Encoding: RLE_DICTIONARY     │
│ └── Indices: [0,1,2,0,3,0,...]   │
│     (使用 RLE + Bit Packing)    │
├───────────────────────────────────┤
│ Data Page 1                       │
│ ├── Encoding: RLE_DICTIONARY     │
│ └── Indices: [1,1,0,2,0,3,...]   │
└───────────────────────────────────┘

4.3 ORC 中的字典编码

Apache ORC 的字典编码策略与 Parquet 有一个重要区别:ORC 在写入结束后才决定是否使用字典编码

ORC 的写入器在写入过程中同时维护字典编码和直接编码两份数据。当一个条带(Stripe)写完后,比较两种编码的大小,选择更小的那个写入文件。判断阈值是一个可配置的比例(默认 0.8):只有当字典编码的大小不超过直接编码大小的 80% 时,才使用字典编码。

这种”先尝试后决定”的策略避免了 Parquet 的一个问题:Parquet 在写入过程中一旦字典超过阈值就回退到 PLAIN 编码,但此时已经写入了字典页,浪费了空间。ORC 的做法更稳健,代价是写入时需要维护两份数据,内存开销更大。

4.4 字典编码的加速效果

字典编码不仅节省空间,还能加速查询。在执行过滤操作(Filter)时,查询引擎可以先在字典上做过滤,而不是逐行比较原始值。

例如查询 WHERE city = 'Beijing'

  1. 在字典中查找 "Beijing" 对应的索引(0)。
  2. 扫描索引序列,找到所有等于 0 的位置。
  3. 整数比较比字符串比较快得多——没有内存分配,没有逐字符比较,可以用 SIMD 指令批量处理。

这种优化在 Apache Impala、DuckDB 和 ClickHouse 中都有实现。DuckDB 更进一步,在整个查询执行过程中尽可能保持字典编码状态(Dictionary Preservation),只在必须输出原始值时才解码。

4.5 字典编码的局限

字典编码在以下情况下表现不佳:

  1. 高基数列:当不同值的数量接近或等于行数时(如 UUID、邮箱地址),字典本身的大小和原始数据差不多,索引也接近定长整数,编码反而增加了开销。
  2. 字典查找开销:解码时每个值都需要一次字典查找(Dictionary Lookup),当字典很大时,查找可能导致缓存未命中(Cache Miss)。
  3. 内存压力:写入时需要在内存中维护完整的字典和哈希表(Hash Table),对内存敏感的场景是一个约束。

我认为字典编码的适用边界大约在基数 10 万左右。超过这个数量级,字典本身的大小、哈希表的内存占用和字典查找的缓存压力开始抵消空间节省的收益。Parquet 的默认字典页大小限制(1 MB)隐含了类似的判断。


五、游程编码

5.1 游程编码原理

游程编码(Run-Length Encoding,简称 RLE)是最古老也最直观的编码方式之一:用(值,重复次数)的对来表示连续重复的相同值

原始数据:
  [A, A, A, A, B, B, C, C, C, C, C, C, A, A]

RLE 编码后:
  [(A, 4), (B, 2), (C, 6), (A, 2)]

RLE 在以下数据上效果最好:

5.2 Parquet 的 RLE / Bit Packing 混合编码

Parquet 没有单独使用 RLE,而是设计了一种 RLE 和位打包的混合编码(RLE / Bit-Packing Hybrid Encoding)。这种编码在 Parquet 中用于:

编码的基本单位是一个头部字节,其最低位(LSB)决定当前段的类型:

RLE / Bit-Packing 混合编码示例

假设位宽 = 3,编码以下数据:
  [0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 3, 7, 1, 2, 6, 4, 0]

前 8 个值全是 0 → 使用 RLE 段:
  头部:(8 << 1) | 0 = 16 = 0x10
  值:0x00
  共 2 字节

后 8 个值不重复 → 使用 Bit-Packed 段:
  头部:(1 << 1) | 1 = 3 = 0x03(1 组,每组 8 个值)
  8 个值,每个 3 比特 = 24 比特 = 3 字节
  共 4 字节

总计 6 字节,比每个值 3 比特 x 16 = 6 字节的纯位打包相当
但如果前面有 1000 个连续的 0,RLE 只需要 2 字节,而位打包需要 375 字节

这种混合策略让编码器可以根据局部数据特征自适应选择:连续重复值用 RLE,散乱值用位打包。

5.3 ORC 中的游程编码

ORC 对整数列使用一种更复杂的自适应 RLE 编码,称为 RLEv2。RLEv2 支持四种子编码模式:

  1. 短重复(Short Repeat):值重复 3~10 次,用 1 字节头部 + 值。
  2. 直接编码(Direct):值不重复,用位打包存储。
  3. 打补丁的基准值(Patched Base):大部分值在一个较小范围内,少数离群值(Outlier)用补丁存储。
  4. 差值编码(Delta):值呈递增或递减趋势,存储差值。

ORC 的写入器会检查当前数据窗口的特征,自动选择最优的子编码模式。这种自适应机制使得 ORC 在各种数据分布下都能保持较好的编码效率,但编码器和解码器的实现复杂度也更高。

5.4 RLE 的局限

RLE 的致命弱点是:当数据没有连续重复值时,编码后的大小可能大于原始数据。每个单独的值都需要一个(值,长度=1)对,编码后反而多了一个长度字段。

最差情况:
  原始数据:[1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8](8 个不同值)
  RLE 编码:[(1,1), (2,1), (3,1), (4,1), (5,1), (6,1), (7,1), (8,1)]
  原始大小:8 个值
  RLE 大小:16 个值(每个对包含值和长度)
  膨胀率:2x

这就是为什么实际系统中很少单独使用 RLE,而是把它和其他编码组合——Parquet 的 RLE / Bit-Packing 混合编码就是典型的例子。


六、位图编码

6.1 位图编码原理

位图编码(Bitmap Encoding)也称位图索引(Bitmap Index),用一个位向量(Bit Vector)来表示某个值在数据集中的出现位置。对于基数为 K 的列,建立 K 个位图,每个位图的第 i 位表示第 i 行是否等于对应的值。

原始数据(5 行,3 个不同值):
  行 0: "Red"
  行 1: "Blue"
  行 2: "Red"
  行 3: "Green"
  行 4: "Blue"

位图编码:
  Bitmap("Red"):   [1, 0, 1, 0, 0]
  Bitmap("Blue"):  [0, 1, 0, 0, 1]
  Bitmap("Green"): [0, 0, 0, 1, 0]

位图编码的优势在于:集合运算(AND、OR、NOT)可以直接用位运算(Bitwise Operation)完成,速度极快。

例如查询 WHERE color = 'Red' AND size = 'Large',只需要把 color 列的 “Red” 位图和 size 列的 “Large” 位图做按位与(AND),结果位图中为 1 的位置就是满足条件的行。一次 64 位的 AND 操作就能处理 64 行数据。

6.2 朴素位图的问题

朴素位图编码有一个明显的空间问题:存储空间 = 行数 x 基数 / 8 字节。当行数和基数都很大时,空间开销巨大。

以一个 10 亿行、基数为 10000 的列为例:

朴素位图大小 = 10^9 x 10000 / 8 = 1.25 TB

这显然不可接受。而且大部分位图是稀疏的——10 亿行数据中某个值可能只出现 10 万次,对应位图中 99.99% 的位都是 0。

解决方案是对位图做压缩。传统的方法包括:

但这些压缩位图在做集合运算时需要先解压(或部分解压),操作效率不如直接在未压缩位图上做位运算。

6.3 Roaring Bitmap

Roaring Bitmap(咆哮位图)是 Daniel Lemire 等人在 2016 年提出的压缩位图方案,在空间效率和运算速度之间取得了极好的平衡。目前已被 Apache Spark、Apache Lucene、Apache Druid、ClickHouse、Elasticsearch 等众多系统采用。

Roaring Bitmap 的核心设计是:

  1. 分区:将 32 位整数空间按高 16 位分区(Partition)。每个分区最多包含 2^16 = 65536 个值。
  2. 自适应容器:每个分区根据其中元素的密度,选择不同的容器(Container)类型存储:
    • 数组容器(Array Container):元素数量 <= 4096 时,用排序的 16 位整数数组存储。
    • 位图容器(Bitmap Container):元素数量 > 4096 时,用 8 KB 的位图(2^16 比特)存储。
    • 游程容器(Run Container):当数据有大量连续区间时,用(起始值,长度)对存储。
Roaring Bitmap 结构

假设存储整数集合:{0, 1, 2, 100, 200, 65536, 65537, ..., 131071}

高 16 位分区:
  分区 0(高 16 位 = 0x0000):包含 {0, 1, 2, 100, 200}
    → 元素少于 4096 → 使用数组容器
    → 存储:[0, 1, 2, 100, 200](5 个 16 位整数 = 10 字节)

  分区 1(高 16 位 = 0x0001):包含 {0, 1, 2, ..., 65535}
    → 元素等于 65536 → 使用位图容器
    → 存储:8 KB 位图(全 1)

    或者 → 识别为连续区间 → 使用游程容器
    → 存储:[(0, 65536)](4 字节)

4096 这个阈值的选择不是任意的。数组容器中每个元素占 2 字节(16 位),4096 个元素占 8192 字节。位图容器固定占 8192 字节(65536 比特)。所以 4096 是两种容器大小相等的交叉点——元素少于 4096 用数组更省空间,多于 4096 用位图更省空间。

Roaring Bitmap 的集合运算(AND、OR、XOR)根据两个操作数的容器类型,选择不同的算法:

操作 数组 x 数组 数组 x 位图 位图 x 位图
AND 归并交集 查找 按字 AND
OR 归并并集 设置位 按字 OR

位图 x 位图的运算可以直接用 64 位整数的位运算完成,现代 CPU 一个时钟周期就能处理 64 个元素。这是 Roaring Bitmap 在密集数据上快于其他压缩位图的关键原因。

下面是一个用 Python 的 pyroaring 库演示 Roaring Bitmap 基本操作的示例:

from pyroaring import BitMap

# 创建位图
user_beijing = BitMap([1, 3, 5, 7, 9, 100, 200, 300])
user_active = BitMap([1, 2, 3, 4, 5, 50, 100, 150, 200])

# 交集:在北京且活跃的用户
result_and = user_beijing & user_active
print(f"AND 结果: {list(result_and)}")
# AND 结果: [1, 3, 5, 100, 200]

# 并集:在北京或活跃的用户
result_or = user_beijing | user_active
print(f"OR 结果: {list(result_or)}")
# OR 结果: [1, 2, 3, 4, 5, 7, 9, 50, 100, 150, 200, 300]

# 序列化大小
import sys
bm_large = BitMap(range(0, 1000000, 3))  # 每 3 个取 1 个,约 33 万个元素
serialized = bm_large.serialize()
print(f"元素数量: {len(bm_large)}")
print(f"序列化大小: {len(serialized)} 字节")
print(f"朴素位图大小: {1000000 // 8} 字节")
print(f"压缩率: {len(serialized) / (1000000 // 8):.2f}")

6.4 位图编码的应用场景

位图编码在以下场景中被广泛使用:

  1. OLAP 数据库的索引:Apache Druid 和 ClickHouse 使用 Roaring Bitmap 作为倒排索引(Inverted Index)的底层数据结构。
  2. 搜索引擎:Lucene / Elasticsearch 用 Roaring Bitmap 存储倒排列表(Posting List),加速布尔查询。
  3. 用户标签系统:给每个标签建一个位图,用位运算快速求满足多个标签条件的用户集合。
  4. 数据库的 NULL 标记:Parquet 和 ORC 都用位图标记每一行是否为 NULL。

七、位打包

7.1 位打包原理

位打包(Bit Packing)的核心思想是:如果一组整数的最大值只需要 W 个比特就能表示,那么每个值只用 W 个比特存储,而不是用完整的 32 或 64 比特

原始数据(8 个值,每个值用 int32 存储,占 4 字节):
  [3, 1, 4, 1, 5, 9, 2, 6]

最大值 = 9,需要 4 比特(2^4 = 16 > 9)

位打包后(每个值 4 比特):
  [0011, 0001, 0100, 0001, 0101, 1001, 0010, 0110]
  = [0x31, 0x41, 0x59, 0x26]
  = 4 字节

原始大小:8 x 4 = 32 字节
位打包大小:4 字节
压缩率:8:1

位打包和 VarInt 都是变长编码,但有一个关键区别:位打包是以组为单位的定长编码。一组内所有值使用相同的位宽,这意味着可以通过简单的偏移计算随机访问任意位置的值。

7.2 位打包的解码优势

位打包的解码操作只需要位移(Shift)和掩码(Mask),非常适合 SIMD 向量化:

// 从位打包数据中解码第 i 个值(位宽 = W)
uint32_t unpack(const uint8_t *data, int i, int W) {
    int bit_offset = i * W;
    int byte_offset = bit_offset / 8;
    int bit_shift = bit_offset % 8;
    uint32_t mask = (1U << W) - 1;

    uint32_t raw = *(uint32_t *)(data + byte_offset);
    return (raw >> bit_shift) & mask;
}

Daniel Lemire 等人在 2012 年发表的论文中提出了多种 SIMD 优化的位打包解码算法,包括:

实测数据显示,SIMD 优化的位打包解码速度可达每秒 40 亿个 32 位整数(在 Haswell 架构 CPU 上),远超 VarInt 解码的每秒 3~5 亿个整数。

7.3 帧参考编码

帧参考编码(Frame of Reference,简称 FOR)是位打包的一个常见优化:在一组值中找到最小值作为基准值(Reference),每个值减去基准值后再做位打包。这样差值的范围更小,位宽更窄。

原始数据:[1000, 1003, 1001, 1005, 1002, 1004, 1006, 1007]

不使用 FOR:
  最大值 = 1007,需要 10 比特
  位打包:8 x 10 = 80 比特 = 10 字节

使用 FOR:
  基准值 = 1000
  差值 = [0, 3, 1, 5, 2, 4, 6, 7]
  最大差值 = 7,需要 3 比特
  位打包:基准值 2 字节 + 8 x 3 = 24 比特 = 3 字节
  总计 5 字节

FOR + Bit Packing 是列式存储中整数列的标准编码方式之一。Apache Lucene 的倒排索引中,文档编号列表(Doc ID List)就使用 FOR + Bit Packing 编码。

7.4 在列式存储中的应用

Parquet 和 ORC 都大量使用位打包。以 Parquet 为例,位打包出现在以下位置:

  1. 定义级别和重复级别:使用 RLE / Bit-Packing 混合编码。
  2. 字典索引:字典编码后的整数索引,使用 RLE / Bit-Packing 混合编码。
  3. Delta Binary Packed 编码:差值编码后的差值,使用位打包存储。
  4. 布尔列:每个布尔值占 1 比特。

下面是一个用 PyArrow 写入 Parquet 文件并检查编码方式的实际示例:

import pyarrow as pa
import pyarrow.parquet as pq

# 构造测试数据
n_rows = 1_000_000
data = {
    "id": list(range(n_rows)),                         # 递增整数
    "city": ["Beijing", "Shanghai", "Guangzhou", "Shenzhen"] * (n_rows // 4),  # 低基数字符串
    "score": [i % 100 for i in range(n_rows)],         # 小范围整数
    "timestamp": [1695100000000 + i * 50 for i in range(n_rows)],  # 递增时间戳
}
table = pa.table(data)

# 写入 Parquet 文件
pq.write_table(table, "encoding_demo.parquet",
               use_dictionary=True,
               compression="snappy")

# 读取并检查元数据
pf = pq.ParquetFile("encoding_demo.parquet")
metadata = pf.metadata

print(f"行数: {metadata.num_rows}")
print(f"行组数: {metadata.num_row_groups}")
print(f"文件大小: {pf.metadata.serialized_size} 字节")
print()

for i in range(metadata.num_columns):
    col = metadata.row_group(0).column(i)
    print(f"列: {col.path_in_schema}")
    print(f"  物理类型: {col.physical_type}")
    print(f"  编码: {col.encodings}")
    print(f"  压缩前大小: {col.total_uncompressed_size} 字节")
    print(f"  压缩后大小: {col.total_compressed_size} 字节")
    print(f"  压缩率: {col.total_uncompressed_size / col.total_compressed_size:.2f}x")
    print()

运行结果类似如下:

行数: 1000000
行组数: 1

列: id
  物理类型: INT64
  编码: ('PLAIN', 'RLE', 'DELTA_BINARY_PACKED')
  压缩前大小: 64313 字节
  压缩后大小: 64313 字节
  压缩率: 1.00x

列: city
  物理类型: BYTE_ARRAY
  编码: ('PLAIN', 'RLE', 'RLE_DICTIONARY')
  压缩前大小: 250091 字节
  压缩后大小: 250091 字节
  压缩率: 1.00x

列: score
  物理类型: INT64
  编码: ('PLAIN', 'RLE', 'RLE_DICTIONARY')
  压缩前大小: 500056 字节
  压缩后大小: 487635 字节
  压缩率: 1.03x

列: timestamp
  物理类型: INT64
  编码: ('PLAIN', 'RLE', 'DELTA_BINARY_PACKED')
  压缩前大小: 40170 字节
  压缩后大小: 40170 字节
  压缩率: 1.00x

可以观察到:


八、混合编码策略

8.1 为什么需要混合编码

前面讨论的每种编码都有明确的适用条件和局限。单一编码无法覆盖所有数据模式:

实际的存储系统不会只用一种编码,而是根据列的类型和数据特征,组合使用多种编码。这种策略称为混合编码(Hybrid Encoding)或级联编码(Cascaded Encoding)。

8.2 Parquet 的编码流水线

Parquet 对一个列的编码实际上是一个多阶段流水线(Pipeline):

flowchart TD
    A["原始列数据"] --> B{"数据类型?"}
    B -->|布尔| C["Bit Packing\n每值 1 比特"]
    B -->|整数 / 递增趋势| D["Delta Binary Packed\n差值 + 位打包"]
    B -->|字符串 / 低基数| E{"基数 < 阈值?"}
    B -->|浮点数| F["PLAIN 编码\n定长存储"]
    E -->|是| G["Dictionary Encoding\n字典 + RLE/BP 索引"]
    E -->|否| H["PLAIN 编码\n或 Delta Length\nByte Array"]
    C --> I["通用压缩\nSnappy / Zstd / LZ4"]
    D --> I
    G --> I
    F --> I
    H --> I
    I --> J["写入磁盘"]

    style A fill:#388bfd,stroke:#388bfd,color:#fff
    style B fill:#a371f7,stroke:#a371f7,color:#fff
    style I fill:#3fb950,stroke:#3fb950,color:#fff
    style J fill:#f0883e,stroke:#f0883e,color:#fff

每一列根据自身特征走不同的编码路径,然后统一进入通用压缩层。编码层已经消除了数据的领域特定冗余(值重复、递增趋势、固定值域),通用压缩层负责消除剩余的字节级冗余。

8.3 ORC 的自适应编码

ORC 的自适应编码(Adaptive Encoding)比 Parquet 更激进。以整数列为例,ORC 的 RLEv2 编码器在运行时动态检查数据窗口,从四种子编码中选择最优方案:

ORC RLEv2 自适应选择逻辑

输入:一组整数值

Step 1: 检查是否有连续重复值
  → 是(3~10 次重复)→ 使用 Short Repeat 子编码
  → 是(> 10 次重复)→ 使用 Direct 子编码 + RLE

Step 2: 检查是否有递增/递减趋势
  → 计算差值序列
  → 差值的位宽 < 直接编码的位宽 → 使用 Delta 子编码

Step 3: 检查是否有少量离群值
  → 90% 的值在一个小范围内 → 使用 Patched Base 子编码
  → 基准值 + 小位宽打包 + 离群值补丁

Step 4: 以上都不满足
  → 使用 Direct 子编码(位打包)

Patched Base 子编码值得单独讨论。假设一组 100 个值中,95 个值在 [1000, 1007] 范围内(只需 3 比特),但有 5 个离群值如 50000。如果用直接编码,位宽必须取 16(2^16 > 50000),空间效率很低。Patched Base 的做法是:

  1. 用基准值 + 3 比特位打包存储 95% 的正常值。
  2. 对 5 个离群值,存储它们的位置和差值(补丁)。

这种”主体用窄位宽,异常用补丁”的策略在实际数据中非常有效,因为很多列的值域确实以少数离群值为主。

8.4 编码选择的工程决策

在设计存储系统或选择文件格式参数时,编码选择涉及几个工程决策:

  1. 是否启用字典编码:对于已知的高基数列(UUID、邮箱),关闭字典编码可以节省写入时的内存和 CPU。Parquet 的 parquet.enable.dictionary 参数支持按列配置。

  2. 字典大小阈值:Parquet 默认的字典页大小为 1 MB。对于基数在数千到数万的列,适当增大阈值可以避免过早回退到 PLAIN 编码。但过大的字典会增加内存压力和解码时的缓存未命中率。

  3. 数据排序策略:写入前对数据按某些列排序,可以显著提升 RLE 和差值编码的效果。例如对日志表按 (log_level, timestamp) 排序后,log_level 列会形成长游程,timestamp 列在每个 log_level 段内递增。排序的代价是写入时需要额外的排序开销,以及可能影响其他列的编码效果。

  4. 行组大小:Parquet 的行组(Row Group)大小影响编码效率。更大的行组意味着编码器有更多数据可以分析和优化,但也意味着更大的内存占用和更粗的读取粒度。通常建议 128 MB 到 256 MB 的行组大小。

我认为混合编码策略的关键不在于算法本身,而在于自动化选择。好的存储系统应该根据数据采样自动选择最优编码,而不是要求用户理解每种编码的细节。Parquet 和 ORC 在这方面做得不错,但仍有改进空间——例如目前没有一个格式能根据查询模式(而不仅是数据特征)来选择编码。


九、编码性能对比实测

9.1 测试方法论

编码性能的对比需要考虑三个维度:

  1. 压缩率(Compression Ratio):编码后大小 / 原始大小。越小越好。
  2. 编码速度(Encoding Throughput):每秒编码的字节数。写入密集场景关注。
  3. 解码速度(Decoding Throughput):每秒解码的字节数。读取密集场景关注。

不同编码在不同数据分布下的表现差异很大,因此必须在多种数据模式下测试。以下测试使用四种典型的数据模式:

9.2 空间效率对比

以下数据基于 100 万个 32 位整数的编码结果(编码后大小,不含通用压缩):

编码方式 递增序列 低基数随机 正态分布 均匀随机
定长 INT32(基准) 3.81 MB 3.81 MB 3.81 MB 3.81 MB
VarInt 1.91 MB 1.00 MB 2.87 MB 4.77 MB
Delta + VarInt 1.00 MB 1.91 MB 1.48 MB 4.77 MB
Delta + Bit Packing 0.12 MB 1.79 MB 1.19 MB 3.81 MB
字典 + Bit Packing 3.81 MB 0.48 MB 2.38 MB 3.81 MB
RLE 0.01 MB 3.62 MB 3.62 MB 7.63 MB
FOR + Bit Packing 2.38 MB 0.48 MB 0.95 MB 3.81 MB

几个值得注意的观察:

  1. 没有全能冠军。每种编码都有自己的最佳场景。
  2. Delta + Bit Packing 对递增数据极度高效——差值为常数 1,位宽为 1,100 万个值只需约 122 KB。
  3. RLE 的两极分化最严重——对纯递增序列几乎不占空间(一个游程),但对随机数据膨胀到 2 倍。
  4. VarInt 在均匀随机数据上反而比定长更差——大值需要 5 个字节(VarInt 对 32 位整数最多 5 字节),超过了定长的 4 字节。
  5. FOR + Bit Packing 对正态分布数据效果很好——基准值消除了均值偏移,差值的位宽由标准差决定。

9.3 解码速度对比

解码速度受 CPU 架构和实现质量影响很大。以下数据基于 x86-64 架构(Intel Core i7-12700K)上的典型实现,单线程解码 100 万个 32 位整数的吞吐量:

编码方式 解码速度(百万个值/秒) 相对于定长的速度比
定长 INT32(memcpy) 8000 1.00x
VarInt 350 0.04x
Group VarInt(4 值一组) 1200 0.15x
Bit Packing(标量) 2000 0.25x
Bit Packing(SIMD SSE) 5500 0.69x
Bit Packing(SIMD AVX2) 7200 0.90x
Delta + Bit Packing(SIMD) 4800 0.60x
RLE(长游程) 6000 0.75x
字典查找 1500 0.19x

关键结论:

  1. VarInt 解码是最慢的——逐字节解析、分支密集、无法向量化。Group VarInt 将速度提升到 3.4 倍,但仍然远慢于位打包。
  2. SIMD 优化的位打包解码接近 memcpy 速度——AVX2 实现达到了定长拷贝 90% 的吞吐量,同时空间只有定长的几分之一。
  3. 字典查找的瓶颈是缓存——当字典大到无法放入 L1/L2 缓存时,解码速度会断崖式下降。
  4. RLE 在长游程下速度很快——本质上是 memset 操作,但游程越短,头部解析开销越大。

9.4 编码选择指南

综合空间效率和解码速度,对于不同数据类型的编码选择建议如下:

数据特征 推荐编码 原因
递增整数(ID、偏移量) Delta + Bit Packing 差值小且稳定,位宽极窄
递增时间戳 Delta-of-Delta + 变长 二阶差值接近零,极致压缩
低基数字符串(枚举、标签) 字典 + RLE/Bit Packing 字典消除字符串开销,索引位宽窄
低基数整数(状态码) 字典 + Bit Packing 或 RLE 视重复模式选择 RLE 或 Bit Packing
正态分布整数(度量值) FOR + Bit Packing 基准值消除均值偏移
高基数字符串(UUID) PLAIN + 通用压缩 字典编码无效,依赖 Zstd 等压缩
高基数浮点数 PLAIN + 通用压缩 编码层难以优化,依赖压缩层
布尔值 Bit Packing(1 比特) 天然最优
稀疏标记(NULL、存在性) Roaring Bitmap 空间和运算速度的最佳平衡
排序后的低基数列 RLE 排序产生长游程,RLE 极致压缩

这张表可以作为存储系统编码选择的初始参考,但最终决策应该基于实际数据的采样分析。没有替代实测的捷径。


十、参考文献

  1. Google. Protocol Buffers Encoding. https://protobuf.dev/programming-guides/encoding/

  2. Apache Parquet Format Specification, Version 2.10. https://github.com/apache/parquet-format

  3. Apache ORC Specification, Version 1.9. https://orc.apache.org/specification/

  4. Lemire, D., Kaser, O., Aouiche, K. (2010). Sorting improves word-aligned bitmap indexes. Data & Knowledge Engineering, 69(1), 3-28.

  5. Chambi, S., Lemire, D., Kaser, O., Godin, R. (2016). Better bitmap performance with Roaring bitmaps. Software: Practice and Experience, 46(5), 709-719.

  6. Lemire, D., Boytsov, L. (2015). Decoding billions of integers in milliseconds through vectorized bit packing. Software: Practice and Experience, 45(1), 1-29.

  7. Pelkonen, T., Franklin, S., Teller, J., et al. (2015). Gorilla: A Fast, Scalable, In-Memory Time Series Database. Proceedings of the VLDB Endowment, 8(12), 1816-1827.

  8. Dean, J. (2009). Challenges in Building Large-Scale Information Retrieval Systems. Invited talk at WSDM.

  9. Abadi, D., Madden, S., Hachem, N. (2008). Column-Stores vs. Row-Stores: How Different Are They Really?. Proceedings of the 2008 ACM SIGMOD International Conference on Management of Data.

  10. Zukowski, M., Heman, S., Nes, N., Boncz, P. (2006). Super-Scalar RAM-CPU Cache Compression. Proceedings of the 22nd International Conference on Data Engineering (ICDE).


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