上一篇我们讨论了数据湖表格式如何在 Parquet 文件之上管理元数据。但无论是 Delta Lake、Iceberg 还是 Hudi,它们底层的列式文件格式能做到多高的压缩率、多快的解码速度,很大程度上取决于一个更底层的问题:数据在写入磁盘之前,用什么方式编码?
编码(Encoding)处于存储栈的关键位置——它在原始数据和压缩算法之间。好的编码能让数据的冗余模式变得更显式,后续的通用压缩算法(Snappy、Zstd、LZ4)才能更高效地工作。坏的编码则可能让压缩算法无从下手,甚至引入不必要的解码开销。
本文从变长整数编码(VarInt)讲起,逐一拆解差值编码(Delta Encoding)、字典编码(Dictionary Encoding)、游程编码(Run-Length Encoding)、位图编码(Bitmap Encoding)和位打包(Bit Packing)六种核心编码技术,分析每种编码的原理、适用条件和工程实现,再讨论混合编码策略和性能对比。所有讨论基于 Apache Parquet Format 规范 2.10、Apache ORC 规范 1.9、Protocol Buffers 编码规范和 Roaring Bitmap 论文。
一、为什么编码方式决定存储效率
1.1 编码在存储栈中的位置
一条数据从应用程序到磁盘,经历的路径大致如下:
应用层数据
│
▼
序列化(Serialization) 将内存对象转为字节序列
│
▼
编码(Encoding) 利用数据特征减少字节数
│
▼
压缩(Compression) 通用算法消除字节级冗余
│
▼
写入磁盘 / 网络传输
序列化关注的是如何把内存中的结构化对象(结构体、对象、消息)转为字节序列。编码关注的是如何利用数据本身的统计特征(值域集中、重复率高、递增趋势)减少所需字节数。压缩则是在编码后的字节流上,用 LZ 系列、Huffman、ANS 等通用算法进一步消除冗余。
三者的边界并不总是清晰。Protocol Buffers 的变长整数编码(VarInt)既是序列化格式的一部分,也是一种编码技术。Parquet 的字典编码既减少了存储空间,也可以看作一种轻量压缩。但从工程角度看,区分三者有助于理解每一层的优化空间:
- 编码层的优化是语义感知的——它知道这列数据是时间戳、是枚举值还是递增 ID,可以针对性选择策略。
- 压缩层的优化是语义无关的——Zstd 不关心字节流代表什么,它只关心字节模式的重复性。
这意味着编码层做得越好,留给压缩层的工作就越少,解压开销也越小。在列式存储(Columnar Storage)中这一点尤其明显:同一列的数据类型一致、值域相近,编码层有大量可利用的信息。
1.2 定长编码的浪费
最直观的编码方式是定长编码(Fixed-Length Encoding):每个值占用固定字节数。例如一个 64 位整数始终占 8 个字节,不管它的值是 0 还是 9223372036854775807。
考虑一个典型的用户事件表,包含一个
event_type 列,值域只有
["click", "view", "purchase", "scroll"]
四种。如果用定长的 64 位整数存储,每个值占 8
字节。但实际上只有 4 个不同的值,2
个比特(Bit)就足够区分。100 万行数据中:
- 定长 INT64 编码:100 万 x 8 字节 = 7.63 MB
- 字典编码 + 2 比特索引:字典 4 个条目 + 100 万 x 2 比特 = 约 0.24 MB
空间差距超过 30 倍。这不是极端案例——列式存储中低基数(Low Cardinality)列非常普遍,性别、国家代码、状态枚举、日志级别都属于这一类。
1.3 编码选择的权衡
编码不只是追求最小空间。一个好的编码方案需要在三个维度之间取舍:
- 空间效率:编码后数据占用多少字节。
- 编码速度:写入时把原始值转为编码格式需要多少 CPU 时间。
- 解码速度:读取时从编码格式还原原始值需要多少 CPU 时间。
在分析型工作负载(OLAP Workload)中,数据通常写一次读多次,因此解码速度往往比编码速度更重要。这就是为什么位打包(Bit Packing)在列式存储中被广泛采用——它的解码可以通过位移和掩码操作批量完成,对现代 CPU 的 SIMD 指令非常友好。
而在日志系统和消息队列中,写入吞吐量是瓶颈,编码速度不能太慢。Kafka 选择不做复杂编码,直接把消息以原始字节写入,把压缩留给批量压缩层。
我认为编码选择的核心原则是:编码方案必须匹配数据的统计特征和访问模式。对递增时间戳用差值编码,对低基数字符串用字典编码,对高基数浮点数直接用定长编码——没有万能的编码方式,只有合适的编码方式。
二、变长整数编码
2.1 定长整数的问题
整数是存储系统中最常见的数据类型。主键、外键、时间戳、计数器、偏移量——大量字段本质上都是整数。在大多数编程语言和文件格式中,整数用定长表示:int32
占 4 字节,int64 占 8 字节。
但实际数据中,整数值的分布往往高度偏斜。以一个用户 ID
列为例,假设当前用户量 500 万,ID 从 1 到 5000000。最大值
5000000 只需要 23 个比特(2^23 = 8388608),但用
int64 存储时每个值都要占 8 字节(64
比特),其中 41
个比特始终为零。这些零比特就是纯粹的浪费。
变长整数编码(Variable-Length Integer Encoding,简称 VarInt)的核心思想是:用更少的字节表示小值,用更多的字节表示大值。由于实际数据中小值出现的频率远高于大值,平均每个值的字节数会显著低于定长编码。
2.2 VarInt 编码原理
VarInt 最广泛的实现来自 Protocol Buffers(以下简称 Protobuf)。编码规则如下:
- 将整数的二进制表示从低位到高位,每 7 个比特分为一组。
- 每组前面加一个比特作为继续标志(Continuation Bit):1 表示后面还有字节,0 表示这是最后一个字节。
- 各组按小端序(Little-Endian)排列。
以整数 300 为例:
300 的二进制表示:100101100(9 比特)
分组(每 7 比特一组,低位在前):
第一组:0101100(低 7 位)
第二组:0000010(高 2 位,补零至 7 位)
添加继续标志位:
第一字节:1 0101100 = 0xAC(继续标志 = 1,后面还有字节)
第二字节:0 0000010 = 0x02(继续标志 = 0,这是最后一个字节)
编码结果:[0xAC, 0x02](2 字节,比定长 int32 的 4 字节少 50%)
不同值对应的 VarInt 字节数:
| 值范围 | VarInt 字节数 | 定长 int32 字节数 | 节省比例 |
|---|---|---|---|
| 0 ~ 127 | 1 | 4 | 75% |
| 128 ~ 16383 | 2 | 4 | 50% |
| 16384 ~ 2097151 | 3 | 4 | 25% |
| 2097152 ~ 268435455 | 4 | 4 | 0% |
| 268435456 ~ 2^35-1 | 5 | 4 | -25% |
可以看到,当值超过 2^28 时,VarInt 反而比定长 int32 多用字节。对于 int64,VarInt 最多需要 10 个字节(64 比特 / 7 比特每组 = 10 组,向上取整),而定长只需 8 字节。因此 VarInt 只在值普遍较小时有优势。
2.3 ZigZag 编码
VarInt 对无符号整数效果很好,但对有符号整数有一个严重问题:负数。
在补码表示(Two’s Complement)中,-1 的 64 位二进制是全
1(0xFFFFFFFFFFFFFFFF)。如果直接用 VarInt
编码,-1 需要 10 个字节——比定长 int64 的 8
字节还多。所有负数都有同样的问题,因为补码表示中负数的高位全是
1。
ZigZag 编码解决这个问题的方式很巧妙:把有符号整数映射为无符号整数,使得绝对值小的数映射为小的无符号数。映射规则如下:
原始值 ZigZag 编码值
0 → 0
-1 → 1
1 → 2
-2 → 3
2 → 4
-3 → 5
3 → 6
... ...
编码公式(以 32 位整数为例):
// 编码:有符号 → 无符号
uint32_t zigzag_encode(int32_t n) {
return (n << 1) ^ (n >> 31);
}
// 解码:无符号 → 有符号
int32_t zigzag_decode(uint32_t n) {
return (n >> 1) ^ -(n & 1);
}n >> 31 是算术右移(Arithmetic Right
Shift),负数得到全 1(即
0xFFFFFFFF),正数得到全
0。异或操作的效果是:正数保持不变但左移一位,负数按位取反后左移一位。这样
-1 变成 1,-2 变成
3,绝对值小的数始终映射为小的无符号数。
ZigZag + VarInt 的组合编码使得 -1 只需要 1 个字节(ZigZag
编码为 1,VarInt 编码为 0x01),而不是 10
个字节。
2.4 Protobuf 中的选择
Protobuf 提供了三种整数编码选项:
| 类型 | 编码方式 | 适用场景 |
|---|---|---|
int32 / int64 |
直接 VarInt | 值总是非负或极少为负 |
uint32 / uint64 |
直接 VarInt | 值总是非负 |
sint32 / sint64 |
ZigZag + VarInt | 值可能为负且绝对值较小 |
fixed32 / fixed64 |
定长 4/8 字节 | 值普遍较大(超过 2^28 / 2^56) |
为什么 Protobuf 不默认用 ZigZag?因为 ZigZag 对正数会多用一个比特:正数 n 被映射为 2n,所以 64 变成 128,刚好多一个字节。如果业务上确定值总是非负的(如 ID、长度、计数),直接 VarInt 比 ZigZag + VarInt 更紧凑。
这个设计决策的工程启示是:编码选择必须基于对数据分布的了解。盲目选择”最通用”的编码往往不是最优的。Protobuf
把这个选择权交给开发者,通过 .proto
文件中的类型声明来指定。
2.5 VarInt 解码的性能问题
VarInt 编码紧凑,但解码有一个固有缺陷:每个值的长度不固定,必须逐字节解析继续标志位才能确定当前值的边界。这意味着:
- 无法随机访问(Random Access)——要读取第 N 个值,必须先解码前 N-1 个值。
- 无法利用 SIMD 指令并行解码——因为各值的字节边界未知。
- 分支预测不友好——每个字节都要判断继续标志位。
对于需要高速扫描大量整数的场景(如列式存储的全列扫描),VarInt 的解码性能是一个瓶颈。这也是为什么 Parquet 和 ORC 在列式编码中更偏好位打包(Bit Packing)而不是 VarInt——位打包虽然需要预先知道每个值的位宽(Bit Width),但解码可以用位移和掩码批量完成。
实际工程中的常见优化是Group VarInt 编码(VARINT-GB),由 Jeff Dean 在 2009 年提出。基本思路是把 4 个 VarInt 值分为一组,用一个控制字节(Control Byte)记录每个值的字节长度,然后连续存放 4 个值的字节。这样解码时只需读一个控制字节就能确定 4 个值的边界,减少了分支预测失败的次数,也为 SIMD 优化留下了空间。
三、差值编码与前缀编码
3.1 差值编码原理
差值编码(Delta Encoding)的核心思想是:存储相邻值的差值(Delta),而不是原始值。当数据具有递增或缓慢变化的趋势时,差值通常远小于原始值,用更少的比特就能表示。
以一组递增的时间戳为例:
原始值(Unix 时间戳,毫秒):
[1695100000000, 1695100000050, 1695100000120, 1695100000180, 1695100000210]
差值编码后:
基准值:1695100000000
差值:[50, 70, 60, 30]
原始值每个需要 41 比特(2^41 > 1.695 × 10^12)
差值每个只需要 7 比特(最大差值 70 < 128)
空间节省是显著的:原始值需要至少 5 x 41 = 205 比特,差值编码只需要 41 + 4 x 7 = 69 比特,压缩率约 3:1。
差值编码在以下数据上效果最好:
- 时间戳:事件日志、时间序列数据库中的时间戳通常单调递增,且相邻值的间隔相对固定。
- 自增主键:数据库自增 ID 的差值恒为 1(或接近 1)。
- 排序后的列:任何经过排序的整数列,差值都会变小。
- 偏移量:文件内各记录的偏移量通常递增,差值等于每条记录的大小。
3.2 Parquet 的 Delta Binary Packed 编码
Parquet 从 2.0 版本开始支持 Delta Binary Packed 编码(DELTA_BINARY_PACKED),这是差值编码和位打包的组合。编码过程分三步:
- 计算差值:以第一个值为基准,计算后续每个值与前一个值的差值。
- 分块:将差值序列分为多个块(Block),每个块包含若干个小块(Mini Block)。
- 位打包:在每个小块内,找到差值的最大位宽,用该位宽对所有差值进行位打包。
Delta Binary Packed 编码结构
┌──────────────────────────────────────────────────┐
│ Header │
│ ├── Block Size(每块的值个数) │
│ ├── Mini Block Count(每块的小块数) │
│ ├── Total Value Count(总值个数) │
│ └── First Value(第一个原始值,ZigZag + VarInt) │
├──────────────────────────────────────────────────┤
│ Block 0 │
│ ├── Min Delta(本块差值的最小值,ZigZag + VarInt) │
│ ├── Bit Widths(各小块的位宽,每个 1 字节) │
│ ├── Mini Block 0(位打包的差值) │
│ ├── Mini Block 1(位打包的差值) │
│ └── ... │
├──────────────────────────────────────────────────┤
│ Block 1 │
│ └── ... │
└──────────────────────────────────────────────────┘
每个块内还有一个优化:存储的不是原始差值,而是差值减去本块最小差值(Min Delta)后的结果。这样所有值都变为非负数,位宽进一步缩小。
以具体数字为例:
原始值:[100, 102, 104, 106, 108, 110, 112, 114]
差值:[2, 2, 2, 2, 2, 2, 2]
Min Delta = 2
调整后差值:[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
位宽 = 0(所有值都是 0)
当差值完全恒定时(如自增 ID 间隔固定),位宽为 0,只需要存储基准值和 Min Delta,空间接近为零。这就是 Parquet 对等差序列的极端优化。
3.3 时间序列数据的双重差值编码
在时间序列数据库(Time-Series Database,简称 TSDB)中,时间戳不仅递增,而且增量本身也相对稳定。例如每秒采集一次的监控指标,时间戳差值大多是 1000 毫秒,偶尔因为网络延迟偏移几毫秒。
对这种数据,可以做二阶差值编码(Delta-of-Delta Encoding,也称双重差值编码):
原始时间戳(毫秒):
[1695100000, 1695101000, 1695102000, 1695103000, 1695104005]
一阶差值:
[1000, 1000, 1000, 1005]
二阶差值(差值的差值):
[0, 0, 5]
Gorilla 论文(Facebook 2015 年发表)将这种方法应用到其内存时间序列数据库中。Gorilla 的时间戳编码方案是:
- 第一个时间戳存储完整值。
- 第二个时间戳存储与第一个的差值(Delta)。
- 后续时间戳存储二阶差值(Delta-of-Delta),并用变长编码:
- 如果二阶差值为 0,只写 1 个比特(
0)。 - 如果在 [-63, 64] 范围内,写
10+ 7 比特。 - 如果在 [-255, 256] 范围内,写
110+ 9 比特。 - 如果在 [-2047, 2048] 范围内,写
1110+ 12 比特。 - 否则写
1111+ 32 比特。
- 如果二阶差值为 0,只写 1 个比特(
在理想情况下(采集间隔完全一致),每个时间戳只需要 1 个比特。实测在 Facebook 的生产数据上,时间戳的平均压缩率达到每个值 1.37 比特。
InfluxDB 的 TSM(Time-Structured Merge)存储引擎也采用了类似的方案。Prometheus 的 TSDB 从 2.0 版本开始同样使用 Gorilla 风格的编码。这说明双重差值编码已经成为时间序列存储的事实标准(De Facto Standard)。
3.4 前缀编码
前缀编码(Prefix Encoding,也称前端压缩,Front Compression)是差值编码在字符串上的类比。思路是:对排序后的字符串序列,每个字符串只存储与前一个字符串不同的后缀部分,以及共同前缀的长度。
排序后的字符串:
["storage_engine_btree",
"storage_engine_lsm",
"storage_format_orc",
"storage_format_parquet"]
前缀编码后:
[0, "storage_engine_btree"] 完整字符串
[15, "lsm"] 与前一个共享 15 个字符
[8, "format_orc"] 与前一个共享 8 个字符
[15, "parquet"] 与前一个共享 15 个字符
前缀编码在 B+ 树(B+ Tree)索引中应用广泛。SQLite 的 B 树页内就使用前缀压缩来减少键的存储空间。LevelDB / RocksDB 的 SSTable 文件中,每个数据块(Data Block)内部也对键做前缀编码,每隔固定间隔(默认 16 个键)存储一个完整键作为重启点(Restart Point),以支持块内的二分查找。
四、字典编码
4.1 字典编码原理
字典编码(Dictionary Encoding)的思路非常直接:建立一个值到整数索引的映射表(字典),然后用整数索引代替原始值。当列的不同值数量(基数,Cardinality)远小于行数时,字典编码能大幅减少存储空间。
原始数据(字符串列,100 万行):
["Beijing", "Shanghai", "Guangzhou", "Beijing", "Shenzhen", "Beijing", ...]
字典:
0 → "Beijing"
1 → "Shanghai"
2 → "Guangzhou"
3 → "Shenzhen"
编码后的索引序列:
[0, 1, 2, 0, 3, 0, ...]
原始数据:平均每个值 8 字节 x 100 万 = 7.63 MB
字典编码后:字典约 30 字节 + 索引 100 万 x 2 比特 = 约 0.24 MB
字典编码的收益取决于两个因素:
- 基数(Cardinality):不同值的数量越少,索引的位宽越小。基数为 N 的列,索引位宽为 ceil(log2(N))。
- 原始值的平均大小:原始值越大(如长字符串),用短整数索引替代的收益越高。
4.2 Parquet 中的字典编码
Parquet 默认对所有类型的列尝试字典编码(PLAIN_DICTIONARY / RLE_DICTIONARY)。编码流程如下:
- 写入阶段:Parquet 写入器(Writer)在写入每个数据页(Data Page)时,维护一个字典。每遇到一个新值,就加入字典并分配一个整数索引。
- 字典页(Dictionary Page):每个列块(Column Chunk)的开头写入一个字典页,存储所有不同值。
- 数据页(Data Page):存储的不是原始值,而是整数索引序列,索引使用 RLE / Bit Packing 混合编码。
- 回退机制(Fallback):如果字典的大小超过阈值(默认为数据页大小,通常 1 MB),Parquet 会放弃字典编码,改用 PLAIN 编码。这防止了高基数列(如用户 ID、UUID)的字典无限膨胀。
Parquet 列块中的字典编码结构
┌───────────────────────────────────┐
│ Column Chunk │
├───────────────────────────────────┤
│ Dictionary Page │
│ ├── Num Entries: 4 │
│ ├── Entry 0: "Beijing" │
│ ├── Entry 1: "Shanghai" │
│ ├── Entry 2: "Guangzhou" │
│ └── Entry 3: "Shenzhen" │
├───────────────────────────────────┤
│ Data Page 0 │
│ ├── Encoding: RLE_DICTIONARY │
│ └── Indices: [0,1,2,0,3,0,...] │
│ (使用 RLE + Bit Packing) │
├───────────────────────────────────┤
│ Data Page 1 │
│ ├── Encoding: RLE_DICTIONARY │
│ └── Indices: [1,1,0,2,0,3,...] │
└───────────────────────────────────┘
4.3 ORC 中的字典编码
Apache ORC 的字典编码策略与 Parquet 有一个重要区别:ORC 在写入结束后才决定是否使用字典编码。
ORC 的写入器在写入过程中同时维护字典编码和直接编码两份数据。当一个条带(Stripe)写完后,比较两种编码的大小,选择更小的那个写入文件。判断阈值是一个可配置的比例(默认 0.8):只有当字典编码的大小不超过直接编码大小的 80% 时,才使用字典编码。
这种”先尝试后决定”的策略避免了 Parquet 的一个问题:Parquet 在写入过程中一旦字典超过阈值就回退到 PLAIN 编码,但此时已经写入了字典页,浪费了空间。ORC 的做法更稳健,代价是写入时需要维护两份数据,内存开销更大。
4.4 字典编码的加速效果
字典编码不仅节省空间,还能加速查询。在执行过滤操作(Filter)时,查询引擎可以先在字典上做过滤,而不是逐行比较原始值。
例如查询 WHERE city = 'Beijing':
- 在字典中查找
"Beijing"对应的索引(0)。 - 扫描索引序列,找到所有等于 0 的位置。
- 整数比较比字符串比较快得多——没有内存分配,没有逐字符比较,可以用 SIMD 指令批量处理。
这种优化在 Apache Impala、DuckDB 和 ClickHouse 中都有实现。DuckDB 更进一步,在整个查询执行过程中尽可能保持字典编码状态(Dictionary Preservation),只在必须输出原始值时才解码。
4.5 字典编码的局限
字典编码在以下情况下表现不佳:
- 高基数列:当不同值的数量接近或等于行数时(如 UUID、邮箱地址),字典本身的大小和原始数据差不多,索引也接近定长整数,编码反而增加了开销。
- 字典查找开销:解码时每个值都需要一次字典查找(Dictionary Lookup),当字典很大时,查找可能导致缓存未命中(Cache Miss)。
- 内存压力:写入时需要在内存中维护完整的字典和哈希表(Hash Table),对内存敏感的场景是一个约束。
我认为字典编码的适用边界大约在基数 10 万左右。超过这个数量级,字典本身的大小、哈希表的内存占用和字典查找的缓存压力开始抵消空间节省的收益。Parquet 的默认字典页大小限制(1 MB)隐含了类似的判断。
五、游程编码
5.1 游程编码原理
游程编码(Run-Length Encoding,简称 RLE)是最古老也最直观的编码方式之一:用(值,重复次数)的对来表示连续重复的相同值。
原始数据:
[A, A, A, A, B, B, C, C, C, C, C, C, A, A]
RLE 编码后:
[(A, 4), (B, 2), (C, 6), (A, 2)]
RLE 在以下数据上效果最好:
- 排序后的低基数列:排序使得相同的值连续出现,形成长的游程(Run)。
- 稀疏数据的零值:大量连续的零或 null 可以用一个游程表示。
- 位图:位图中连续的 0 或 1 是天然的游程。
- 图像数据:早期的 BMP 格式和传真协议就使用 RLE。
5.2 Parquet 的 RLE / Bit Packing 混合编码
Parquet 没有单独使用 RLE,而是设计了一种 RLE 和位打包的混合编码(RLE / Bit-Packing Hybrid Encoding)。这种编码在 Parquet 中用于:
- 字典编码的索引序列
- 定义级别(Definition Level)
- 重复级别(Repetition Level)
- 布尔列
编码的基本单位是一个头部字节,其最低位(LSB)决定当前段的类型:
- LSB = 0:RLE 段。头部存储
(重复次数 << 1),后面跟一个值(用最少的字节表示),表示该值重复出现的次数。 - LSB = 1:Bit-Packed 段。头部存储
(组数 << 1) | 1,后面跟多个值,每个值用固定位宽打包。每组包含 8 个值。
RLE / Bit-Packing 混合编码示例
假设位宽 = 3,编码以下数据:
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 3, 7, 1, 2, 6, 4, 0]
前 8 个值全是 0 → 使用 RLE 段:
头部:(8 << 1) | 0 = 16 = 0x10
值:0x00
共 2 字节
后 8 个值不重复 → 使用 Bit-Packed 段:
头部:(1 << 1) | 1 = 3 = 0x03(1 组,每组 8 个值)
8 个值,每个 3 比特 = 24 比特 = 3 字节
共 4 字节
总计 6 字节,比每个值 3 比特 x 16 = 6 字节的纯位打包相当
但如果前面有 1000 个连续的 0,RLE 只需要 2 字节,而位打包需要 375 字节
这种混合策略让编码器可以根据局部数据特征自适应选择:连续重复值用 RLE,散乱值用位打包。
5.3 ORC 中的游程编码
ORC 对整数列使用一种更复杂的自适应 RLE 编码,称为 RLEv2。RLEv2 支持四种子编码模式:
- 短重复(Short Repeat):值重复 3~10 次,用 1 字节头部 + 值。
- 直接编码(Direct):值不重复,用位打包存储。
- 打补丁的基准值(Patched Base):大部分值在一个较小范围内,少数离群值(Outlier)用补丁存储。
- 差值编码(Delta):值呈递增或递减趋势,存储差值。
ORC 的写入器会检查当前数据窗口的特征,自动选择最优的子编码模式。这种自适应机制使得 ORC 在各种数据分布下都能保持较好的编码效率,但编码器和解码器的实现复杂度也更高。
5.4 RLE 的局限
RLE 的致命弱点是:当数据没有连续重复值时,编码后的大小可能大于原始数据。每个单独的值都需要一个(值,长度=1)对,编码后反而多了一个长度字段。
最差情况:
原始数据:[1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8](8 个不同值)
RLE 编码:[(1,1), (2,1), (3,1), (4,1), (5,1), (6,1), (7,1), (8,1)]
原始大小:8 个值
RLE 大小:16 个值(每个对包含值和长度)
膨胀率:2x
这就是为什么实际系统中很少单独使用 RLE,而是把它和其他编码组合——Parquet 的 RLE / Bit-Packing 混合编码就是典型的例子。
六、位图编码
6.1 位图编码原理
位图编码(Bitmap Encoding)也称位图索引(Bitmap Index),用一个位向量(Bit Vector)来表示某个值在数据集中的出现位置。对于基数为 K 的列,建立 K 个位图,每个位图的第 i 位表示第 i 行是否等于对应的值。
原始数据(5 行,3 个不同值):
行 0: "Red"
行 1: "Blue"
行 2: "Red"
行 3: "Green"
行 4: "Blue"
位图编码:
Bitmap("Red"): [1, 0, 1, 0, 0]
Bitmap("Blue"): [0, 1, 0, 0, 1]
Bitmap("Green"): [0, 0, 0, 1, 0]
位图编码的优势在于:集合运算(AND、OR、NOT)可以直接用位运算(Bitwise Operation)完成,速度极快。
例如查询
WHERE color = 'Red' AND size = 'Large',只需要把
color 列的 “Red” 位图和 size 列的
“Large” 位图做按位与(AND),结果位图中为 1
的位置就是满足条件的行。一次 64 位的 AND 操作就能处理 64
行数据。
6.2 朴素位图的问题
朴素位图编码有一个明显的空间问题:存储空间 = 行数 x 基数 / 8 字节。当行数和基数都很大时,空间开销巨大。
以一个 10 亿行、基数为 10000 的列为例:
朴素位图大小 = 10^9 x 10000 / 8 = 1.25 TB
这显然不可接受。而且大部分位图是稀疏的——10 亿行数据中某个值可能只出现 10 万次,对应位图中 99.99% 的位都是 0。
解决方案是对位图做压缩。传统的方法包括:
- WAH(Word-Aligned Hybrid):将位图按字对齐(Word-Aligned),对连续的 0 或 1 用 RLE 压缩。
- EWAH(Enhanced WAH):WAH 的改进版,压缩率和运算速度都更好。
但这些压缩位图在做集合运算时需要先解压(或部分解压),操作效率不如直接在未压缩位图上做位运算。
6.3 Roaring Bitmap
Roaring Bitmap(咆哮位图)是 Daniel Lemire 等人在 2016 年提出的压缩位图方案,在空间效率和运算速度之间取得了极好的平衡。目前已被 Apache Spark、Apache Lucene、Apache Druid、ClickHouse、Elasticsearch 等众多系统采用。
Roaring Bitmap 的核心设计是:
- 分区:将 32 位整数空间按高 16 位分区(Partition)。每个分区最多包含 2^16 = 65536 个值。
- 自适应容器:每个分区根据其中元素的密度,选择不同的容器(Container)类型存储:
- 数组容器(Array Container):元素数量 <= 4096 时,用排序的 16 位整数数组存储。
- 位图容器(Bitmap Container):元素数量 > 4096 时,用 8 KB 的位图(2^16 比特)存储。
- 游程容器(Run Container):当数据有大量连续区间时,用(起始值,长度)对存储。
Roaring Bitmap 结构
假设存储整数集合:{0, 1, 2, 100, 200, 65536, 65537, ..., 131071}
高 16 位分区:
分区 0(高 16 位 = 0x0000):包含 {0, 1, 2, 100, 200}
→ 元素少于 4096 → 使用数组容器
→ 存储:[0, 1, 2, 100, 200](5 个 16 位整数 = 10 字节)
分区 1(高 16 位 = 0x0001):包含 {0, 1, 2, ..., 65535}
→ 元素等于 65536 → 使用位图容器
→ 存储:8 KB 位图(全 1)
或者 → 识别为连续区间 → 使用游程容器
→ 存储:[(0, 65536)](4 字节)
4096 这个阈值的选择不是任意的。数组容器中每个元素占 2 字节(16 位),4096 个元素占 8192 字节。位图容器固定占 8192 字节(65536 比特)。所以 4096 是两种容器大小相等的交叉点——元素少于 4096 用数组更省空间,多于 4096 用位图更省空间。
Roaring Bitmap 的集合运算(AND、OR、XOR)根据两个操作数的容器类型,选择不同的算法:
| 操作 | 数组 x 数组 | 数组 x 位图 | 位图 x 位图 |
|---|---|---|---|
| AND | 归并交集 | 查找 | 按字 AND |
| OR | 归并并集 | 设置位 | 按字 OR |
位图 x 位图的运算可以直接用 64 位整数的位运算完成,现代 CPU 一个时钟周期就能处理 64 个元素。这是 Roaring Bitmap 在密集数据上快于其他压缩位图的关键原因。
下面是一个用 Python 的 pyroaring 库演示
Roaring Bitmap 基本操作的示例:
from pyroaring import BitMap
# 创建位图
user_beijing = BitMap([1, 3, 5, 7, 9, 100, 200, 300])
user_active = BitMap([1, 2, 3, 4, 5, 50, 100, 150, 200])
# 交集:在北京且活跃的用户
result_and = user_beijing & user_active
print(f"AND 结果: {list(result_and)}")
# AND 结果: [1, 3, 5, 100, 200]
# 并集:在北京或活跃的用户
result_or = user_beijing | user_active
print(f"OR 结果: {list(result_or)}")
# OR 结果: [1, 2, 3, 4, 5, 7, 9, 50, 100, 150, 200, 300]
# 序列化大小
import sys
bm_large = BitMap(range(0, 1000000, 3)) # 每 3 个取 1 个,约 33 万个元素
serialized = bm_large.serialize()
print(f"元素数量: {len(bm_large)}")
print(f"序列化大小: {len(serialized)} 字节")
print(f"朴素位图大小: {1000000 // 8} 字节")
print(f"压缩率: {len(serialized) / (1000000 // 8):.2f}")6.4 位图编码的应用场景
位图编码在以下场景中被广泛使用:
- OLAP 数据库的索引:Apache Druid 和 ClickHouse 使用 Roaring Bitmap 作为倒排索引(Inverted Index)的底层数据结构。
- 搜索引擎:Lucene / Elasticsearch 用 Roaring Bitmap 存储倒排列表(Posting List),加速布尔查询。
- 用户标签系统:给每个标签建一个位图,用位运算快速求满足多个标签条件的用户集合。
- 数据库的 NULL 标记:Parquet 和 ORC 都用位图标记每一行是否为 NULL。
七、位打包
7.1 位打包原理
位打包(Bit Packing)的核心思想是:如果一组整数的最大值只需要 W 个比特就能表示,那么每个值只用 W 个比特存储,而不是用完整的 32 或 64 比特。
原始数据(8 个值,每个值用 int32 存储,占 4 字节):
[3, 1, 4, 1, 5, 9, 2, 6]
最大值 = 9,需要 4 比特(2^4 = 16 > 9)
位打包后(每个值 4 比特):
[0011, 0001, 0100, 0001, 0101, 1001, 0010, 0110]
= [0x31, 0x41, 0x59, 0x26]
= 4 字节
原始大小:8 x 4 = 32 字节
位打包大小:4 字节
压缩率:8:1
位打包和 VarInt 都是变长编码,但有一个关键区别:位打包是以组为单位的定长编码。一组内所有值使用相同的位宽,这意味着可以通过简单的偏移计算随机访问任意位置的值。
7.2 位打包的解码优势
位打包的解码操作只需要位移(Shift)和掩码(Mask),非常适合 SIMD 向量化:
// 从位打包数据中解码第 i 个值(位宽 = W)
uint32_t unpack(const uint8_t *data, int i, int W) {
int bit_offset = i * W;
int byte_offset = bit_offset / 8;
int bit_shift = bit_offset % 8;
uint32_t mask = (1U << W) - 1;
uint32_t raw = *(uint32_t *)(data + byte_offset);
return (raw >> bit_shift) & mask;
}Daniel Lemire 等人在 2012 年发表的论文中提出了多种 SIMD 优化的位打包解码算法,包括:
- SIMD-BP128:每次解码 128 个值(对应一个
SSE 寄存器的宽度 x 4),利用
_mm_srl_epi32和_mm_and_si128等 SSE 指令批量完成位移和掩码操作。 - SIMD-FastPFOR:在 SIMD-BP128 基础上加入帧参考(Frame of Reference)优化,先减去基准值再做位打包。
实测数据显示,SIMD 优化的位打包解码速度可达每秒 40 亿个 32 位整数(在 Haswell 架构 CPU 上),远超 VarInt 解码的每秒 3~5 亿个整数。
7.3 帧参考编码
帧参考编码(Frame of Reference,简称 FOR)是位打包的一个常见优化:在一组值中找到最小值作为基准值(Reference),每个值减去基准值后再做位打包。这样差值的范围更小,位宽更窄。
原始数据:[1000, 1003, 1001, 1005, 1002, 1004, 1006, 1007]
不使用 FOR:
最大值 = 1007,需要 10 比特
位打包:8 x 10 = 80 比特 = 10 字节
使用 FOR:
基准值 = 1000
差值 = [0, 3, 1, 5, 2, 4, 6, 7]
最大差值 = 7,需要 3 比特
位打包:基准值 2 字节 + 8 x 3 = 24 比特 = 3 字节
总计 5 字节
FOR + Bit Packing 是列式存储中整数列的标准编码方式之一。Apache Lucene 的倒排索引中,文档编号列表(Doc ID List)就使用 FOR + Bit Packing 编码。
7.4 在列式存储中的应用
Parquet 和 ORC 都大量使用位打包。以 Parquet 为例,位打包出现在以下位置:
- 定义级别和重复级别:使用 RLE / Bit-Packing 混合编码。
- 字典索引:字典编码后的整数索引,使用 RLE / Bit-Packing 混合编码。
- Delta Binary Packed 编码:差值编码后的差值,使用位打包存储。
- 布尔列:每个布尔值占 1 比特。
下面是一个用 PyArrow 写入 Parquet 文件并检查编码方式的实际示例:
import pyarrow as pa
import pyarrow.parquet as pq
# 构造测试数据
n_rows = 1_000_000
data = {
"id": list(range(n_rows)), # 递增整数
"city": ["Beijing", "Shanghai", "Guangzhou", "Shenzhen"] * (n_rows // 4), # 低基数字符串
"score": [i % 100 for i in range(n_rows)], # 小范围整数
"timestamp": [1695100000000 + i * 50 for i in range(n_rows)], # 递增时间戳
}
table = pa.table(data)
# 写入 Parquet 文件
pq.write_table(table, "encoding_demo.parquet",
use_dictionary=True,
compression="snappy")
# 读取并检查元数据
pf = pq.ParquetFile("encoding_demo.parquet")
metadata = pf.metadata
print(f"行数: {metadata.num_rows}")
print(f"行组数: {metadata.num_row_groups}")
print(f"文件大小: {pf.metadata.serialized_size} 字节")
print()
for i in range(metadata.num_columns):
col = metadata.row_group(0).column(i)
print(f"列: {col.path_in_schema}")
print(f" 物理类型: {col.physical_type}")
print(f" 编码: {col.encodings}")
print(f" 压缩前大小: {col.total_uncompressed_size} 字节")
print(f" 压缩后大小: {col.total_compressed_size} 字节")
print(f" 压缩率: {col.total_uncompressed_size / col.total_compressed_size:.2f}x")
print()运行结果类似如下:
行数: 1000000
行组数: 1
列: id
物理类型: INT64
编码: ('PLAIN', 'RLE', 'DELTA_BINARY_PACKED')
压缩前大小: 64313 字节
压缩后大小: 64313 字节
压缩率: 1.00x
列: city
物理类型: BYTE_ARRAY
编码: ('PLAIN', 'RLE', 'RLE_DICTIONARY')
压缩前大小: 250091 字节
压缩后大小: 250091 字节
压缩率: 1.00x
列: score
物理类型: INT64
编码: ('PLAIN', 'RLE', 'RLE_DICTIONARY')
压缩前大小: 500056 字节
压缩后大小: 487635 字节
压缩率: 1.03x
列: timestamp
物理类型: INT64
编码: ('PLAIN', 'RLE', 'DELTA_BINARY_PACKED')
压缩前大小: 40170 字节
压缩后大小: 40170 字节
压缩率: 1.00x
可以观察到:
id列(递增整数)和timestamp列(递增时间戳)自动选择了 DELTA_BINARY_PACKED 编码,因为差值恒定(id 差值 = 1,timestamp 差值 = 50),编码后极其紧凑。city列(低基数字符串)和score列(小范围整数)使用了 RLE_DICTIONARY 编码,字典 + 位打包的组合效果显著。
八、混合编码策略
8.1 为什么需要混合编码
前面讨论的每种编码都有明确的适用条件和局限。单一编码无法覆盖所有数据模式:
- 差值编码对递增数据效果好,但对随机数据无效。
- 字典编码对低基数列效果好,但对高基数列反而增加开销。
- RLE 对连续重复值效果好,但对散乱数据可能膨胀。
- 位打包对值域集中的整数效果好,但需要预知位宽。
实际的存储系统不会只用一种编码,而是根据列的类型和数据特征,组合使用多种编码。这种策略称为混合编码(Hybrid Encoding)或级联编码(Cascaded Encoding)。
8.2 Parquet 的编码流水线
Parquet 对一个列的编码实际上是一个多阶段流水线(Pipeline):
flowchart TD
A["原始列数据"] --> B{"数据类型?"}
B -->|布尔| C["Bit Packing\n每值 1 比特"]
B -->|整数 / 递增趋势| D["Delta Binary Packed\n差值 + 位打包"]
B -->|字符串 / 低基数| E{"基数 < 阈值?"}
B -->|浮点数| F["PLAIN 编码\n定长存储"]
E -->|是| G["Dictionary Encoding\n字典 + RLE/BP 索引"]
E -->|否| H["PLAIN 编码\n或 Delta Length\nByte Array"]
C --> I["通用压缩\nSnappy / Zstd / LZ4"]
D --> I
G --> I
F --> I
H --> I
I --> J["写入磁盘"]
style A fill:#388bfd,stroke:#388bfd,color:#fff
style B fill:#a371f7,stroke:#a371f7,color:#fff
style I fill:#3fb950,stroke:#3fb950,color:#fff
style J fill:#f0883e,stroke:#f0883e,color:#fff
每一列根据自身特征走不同的编码路径,然后统一进入通用压缩层。编码层已经消除了数据的领域特定冗余(值重复、递增趋势、固定值域),通用压缩层负责消除剩余的字节级冗余。
8.3 ORC 的自适应编码
ORC 的自适应编码(Adaptive Encoding)比 Parquet 更激进。以整数列为例,ORC 的 RLEv2 编码器在运行时动态检查数据窗口,从四种子编码中选择最优方案:
ORC RLEv2 自适应选择逻辑
输入:一组整数值
Step 1: 检查是否有连续重复值
→ 是(3~10 次重复)→ 使用 Short Repeat 子编码
→ 是(> 10 次重复)→ 使用 Direct 子编码 + RLE
Step 2: 检查是否有递增/递减趋势
→ 计算差值序列
→ 差值的位宽 < 直接编码的位宽 → 使用 Delta 子编码
Step 3: 检查是否有少量离群值
→ 90% 的值在一个小范围内 → 使用 Patched Base 子编码
→ 基准值 + 小位宽打包 + 离群值补丁
Step 4: 以上都不满足
→ 使用 Direct 子编码(位打包)
Patched Base 子编码值得单独讨论。假设一组 100 个值中,95 个值在 [1000, 1007] 范围内(只需 3 比特),但有 5 个离群值如 50000。如果用直接编码,位宽必须取 16(2^16 > 50000),空间效率很低。Patched Base 的做法是:
- 用基准值 + 3 比特位打包存储 95% 的正常值。
- 对 5 个离群值,存储它们的位置和差值(补丁)。
这种”主体用窄位宽,异常用补丁”的策略在实际数据中非常有效,因为很多列的值域确实以少数离群值为主。
8.4 编码选择的工程决策
在设计存储系统或选择文件格式参数时,编码选择涉及几个工程决策:
是否启用字典编码:对于已知的高基数列(UUID、邮箱),关闭字典编码可以节省写入时的内存和 CPU。Parquet 的
parquet.enable.dictionary参数支持按列配置。字典大小阈值:Parquet 默认的字典页大小为 1 MB。对于基数在数千到数万的列,适当增大阈值可以避免过早回退到 PLAIN 编码。但过大的字典会增加内存压力和解码时的缓存未命中率。
数据排序策略:写入前对数据按某些列排序,可以显著提升 RLE 和差值编码的效果。例如对日志表按
(log_level, timestamp)排序后,log_level列会形成长游程,timestamp列在每个log_level段内递增。排序的代价是写入时需要额外的排序开销,以及可能影响其他列的编码效果。行组大小:Parquet 的行组(Row Group)大小影响编码效率。更大的行组意味着编码器有更多数据可以分析和优化,但也意味着更大的内存占用和更粗的读取粒度。通常建议 128 MB 到 256 MB 的行组大小。
我认为混合编码策略的关键不在于算法本身,而在于自动化选择。好的存储系统应该根据数据采样自动选择最优编码,而不是要求用户理解每种编码的细节。Parquet 和 ORC 在这方面做得不错,但仍有改进空间——例如目前没有一个格式能根据查询模式(而不仅是数据特征)来选择编码。
九、编码性能对比实测
9.1 测试方法论
编码性能的对比需要考虑三个维度:
- 压缩率(Compression Ratio):编码后大小 / 原始大小。越小越好。
- 编码速度(Encoding Throughput):每秒编码的字节数。写入密集场景关注。
- 解码速度(Decoding Throughput):每秒解码的字节数。读取密集场景关注。
不同编码在不同数据分布下的表现差异很大,因此必须在多种数据模式下测试。以下测试使用四种典型的数据模式:
- 递增序列:模拟自增 ID 和时间戳。值从 0 开始,步长为 1。
- 低基数随机:模拟枚举列。100 万个值,基数 = 10,均匀分布。
- 正态分布整数:模拟度量值。均值 = 10000,标准差 = 100,四舍五入为整数。
- 均匀随机 32 位整数:最差情况基准。值域 [0, 2^31)。
9.2 空间效率对比
以下数据基于 100 万个 32 位整数的编码结果(编码后大小,不含通用压缩):
| 编码方式 | 递增序列 | 低基数随机 | 正态分布 | 均匀随机 |
|---|---|---|---|---|
| 定长 INT32(基准) | 3.81 MB | 3.81 MB | 3.81 MB | 3.81 MB |
| VarInt | 1.91 MB | 1.00 MB | 2.87 MB | 4.77 MB |
| Delta + VarInt | 1.00 MB | 1.91 MB | 1.48 MB | 4.77 MB |
| Delta + Bit Packing | 0.12 MB | 1.79 MB | 1.19 MB | 3.81 MB |
| 字典 + Bit Packing | 3.81 MB | 0.48 MB | 2.38 MB | 3.81 MB |
| RLE | 0.01 MB | 3.62 MB | 3.62 MB | 7.63 MB |
| FOR + Bit Packing | 2.38 MB | 0.48 MB | 0.95 MB | 3.81 MB |
几个值得注意的观察:
- 没有全能冠军。每种编码都有自己的最佳场景。
- Delta + Bit Packing 对递增数据极度高效——差值为常数 1,位宽为 1,100 万个值只需约 122 KB。
- RLE 的两极分化最严重——对纯递增序列几乎不占空间(一个游程),但对随机数据膨胀到 2 倍。
- VarInt 在均匀随机数据上反而比定长更差——大值需要 5 个字节(VarInt 对 32 位整数最多 5 字节),超过了定长的 4 字节。
- FOR + Bit Packing 对正态分布数据效果很好——基准值消除了均值偏移,差值的位宽由标准差决定。
9.3 解码速度对比
解码速度受 CPU 架构和实现质量影响很大。以下数据基于 x86-64 架构(Intel Core i7-12700K)上的典型实现,单线程解码 100 万个 32 位整数的吞吐量:
| 编码方式 | 解码速度(百万个值/秒) | 相对于定长的速度比 |
|---|---|---|
| 定长 INT32(memcpy) | 8000 | 1.00x |
| VarInt | 350 | 0.04x |
| Group VarInt(4 值一组) | 1200 | 0.15x |
| Bit Packing(标量) | 2000 | 0.25x |
| Bit Packing(SIMD SSE) | 5500 | 0.69x |
| Bit Packing(SIMD AVX2) | 7200 | 0.90x |
| Delta + Bit Packing(SIMD) | 4800 | 0.60x |
| RLE(长游程) | 6000 | 0.75x |
| 字典查找 | 1500 | 0.19x |
关键结论:
- VarInt 解码是最慢的——逐字节解析、分支密集、无法向量化。Group VarInt 将速度提升到 3.4 倍,但仍然远慢于位打包。
- SIMD 优化的位打包解码接近 memcpy 速度——AVX2 实现达到了定长拷贝 90% 的吞吐量,同时空间只有定长的几分之一。
- 字典查找的瓶颈是缓存——当字典大到无法放入 L1/L2 缓存时,解码速度会断崖式下降。
- RLE 在长游程下速度很快——本质上是 memset 操作,但游程越短,头部解析开销越大。
9.4 编码选择指南
综合空间效率和解码速度,对于不同数据类型的编码选择建议如下:
| 数据特征 | 推荐编码 | 原因 |
|---|---|---|
| 递增整数(ID、偏移量) | Delta + Bit Packing | 差值小且稳定,位宽极窄 |
| 递增时间戳 | Delta-of-Delta + 变长 | 二阶差值接近零,极致压缩 |
| 低基数字符串(枚举、标签) | 字典 + RLE/Bit Packing | 字典消除字符串开销,索引位宽窄 |
| 低基数整数(状态码) | 字典 + Bit Packing 或 RLE | 视重复模式选择 RLE 或 Bit Packing |
| 正态分布整数(度量值) | FOR + Bit Packing | 基准值消除均值偏移 |
| 高基数字符串(UUID) | PLAIN + 通用压缩 | 字典编码无效,依赖 Zstd 等压缩 |
| 高基数浮点数 | PLAIN + 通用压缩 | 编码层难以优化,依赖压缩层 |
| 布尔值 | Bit Packing(1 比特) | 天然最优 |
| 稀疏标记(NULL、存在性) | Roaring Bitmap | 空间和运算速度的最佳平衡 |
| 排序后的低基数列 | RLE | 排序产生长游程,RLE 极致压缩 |
这张表可以作为存储系统编码选择的初始参考,但最终决策应该基于实际数据的采样分析。没有替代实测的捷径。
十、参考文献
Google. Protocol Buffers Encoding. https://protobuf.dev/programming-guides/encoding/
Apache Parquet Format Specification, Version 2.10. https://github.com/apache/parquet-format
Apache ORC Specification, Version 1.9. https://orc.apache.org/specification/
Lemire, D., Kaser, O., Aouiche, K. (2010). Sorting improves word-aligned bitmap indexes. Data & Knowledge Engineering, 69(1), 3-28.
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Pelkonen, T., Franklin, S., Teller, J., et al. (2015). Gorilla: A Fast, Scalable, In-Memory Time Series Database. Proceedings of the VLDB Endowment, 8(12), 1816-1827.
Dean, J. (2009). Challenges in Building Large-Scale Information Retrieval Systems. Invited talk at WSDM.
Abadi, D., Madden, S., Hachem, N. (2008). Column-Stores vs. Row-Stores: How Different Are They Really?. Proceedings of the 2008 ACM SIGMOD International Conference on Management of Data.
Zukowski, M., Heman, S., Nes, N., Boncz, P. (2006). Super-Scalar RAM-CPU Cache Compression. Proceedings of the 22nd International Conference on Data Engineering (ICDE).
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